ภายในถ้ำน้ำทะลุ แบ่งออกเป็น 3 ส่วนด้วยกัน ได้แก่ ส่วนแรกเป็นบริเวณทางเข้าถ้ำที่มีแสงสว่างส่องลงมา จึงสามารถมองเห็นความงามของผนังถ้ำที่ปกคลุมไปด้วยหินงอกหินย้อยรูปร่างแปลกตา ส่วนที่สองเป็นบริเวณที่มืดสนิท นักท่องเที่ยวจำเป็นต้องใช้ไฟฉาย ซึ่งจะได้พบกับหินงอกหินย้อยที่มีขนาดใหญ่และสวยงามมากมาย ส่วนที่สามเป็นบริเวณที่มีน้ำทะเลไหลผ่าน จึงทำให้เกิดโพรงขนาดใหญ่ที่สามารถลอดออกไปได้อีกด้านหนึ่ง โดยบริเวณนี้มีหินงอกหินย้อยที่สวยงามแปลกตาไม่แพ้ส่วนอื่นๆ
การเข้าชมถ้ำน้ำทะลุ ต้องนั่งเรือไปประมาณ 10 นาที จากนั้นเดินเท้าขึ้นไปยังปากถ้ำอีกประมาณ 10 นาที ซึ่งเส้นทางขึ้นค่อนข้างชันและค่อนข้างลื่น จึงต้องใช้ความระมัดระวังเป็นพิเศษ โดยการเข้าชมนั้นจะต้องมีเจ้าหน้าที่นำทาง เนื่องจากภายในถ้ำมีบางจุดที่มืดสนิทและมีทางแยกหลายทาง เพื่อความปลอดภัยจึงควรปฏิบัติตามคำแนะนำของเจ้าหน้าที่อย่างเคร่งครัด
ถ้ำน้ำทะลุ ถือเป็นถ้ำที่สวยงามแปลกตา และมีเสน่ห์ที่ไม่เหมือนใคร นักท่องเที่ยวที่เดินทางมาเยือนเมืองวังเวียง ควรจัดสรรเวลาเพื่อมาเที่ยวชมถ้ำแห่งนี้ เพื่อสัมผัสความงามอันอลังการของธรรมชาติ และเก็บเกี่ยวประสบการณ์ที่น่าประทับใจกลับไปเป็นความทรงจำอันล้ำค่า
เคล็ดลับและคำแนะนำ