FUNAIは1967年に設立され、ブラジルに約100万人の先住民が住む234の領土を管理する責任を負っている。同機関は、土地を保護し、先住民族の伝統的な生活様式を守るために活動している。しかし、FUNAIの活動が果たして先住民族にとって有益なのか、それとも害を及ぼしているのかについては、依然として議論が続いている。
FUNAIの批評家は、同機関が先住民族の土地を保護するのに成功していないと主張している。ブラジルでは、先住民族の領土の20%以上が違法に伐採されており、先住民族の土地の境界線は依然として明確に定義されていない。さらに、先住民族の土地には農場主、鉱業会社、その他の企業が違法に侵入しており、先住民族の生活に脅威を与えている。
また、FUNAIは政府の利権に寄り添いすぎて、先住民族の権利を守るのに消極的すぎるとも非難されている。例えば、2016年、ブラジルの議会は先住民族の土地における鉱業を合法化する法案を承認したが、FUNAIはその策定に関与した。この法律は先住民族の権利にとって大きな後退であり、この法律を支持したことで、FUNAIに対する信頼が失われた。
しかし、FUNAIには擁護者もいる。同機関は先住民族の権利のために戦うために多くの仕事をしており、先住民族の生活様式を守ることに成功していると主張している。例えば、FUNAIは先住民族の領土を保護する多くの法廷闘争に関与しており、先住民族のための学校や病院を開設するなど、他の多くの支援プログラムも提供している。
結局のところ、FUNAIがブラジルの先住民にとって救世主であるのか悪者であるのかは複雑な問題である。同機関には、先住民族の権利を守るために多くの仕事を果たしてきた実績があるが、同機関には改善できる点もいくつかある。FUNAIが先住民族の生活に真に有益な役割を果たすためには、政府の利権から独立し、先住民族の権利を強力に擁護する必要があるだろう。